Pada 20 Mei 1908 di Batavia, ditemukan masyarakat politik pribumi pertama, yaitu "Budi Oetomo". Budi Oetomo telah menandai gerakan nasionalis pertama di awal abad kedua puluh dalam sejarah Jawa Indonesia .
Pada tahun 1911, di Jawa Tengah berdiri Serikat Dagang Islam ( SDI). Organisasi ini didirikan oleh HOS Tjokroaminoto. Pada 1912, SDI menjadi " Sarekat Islam " (SI). Organisasi ini berkembang ke daerah lain di seluruh Indonesia
Kemudian di Bandung pada 17-18 Desember 1927 berdiri Perhimpunan Politik Indonesia ( Perhimpunan-Perhimpunan Politik Kebangsaan Indonesia , PPPKI). PPPKI adalah asosiasi organisasi asli yang bertujuan untuk membebaskan Indonesia. Organisasi ini terdiri dari PNI, SI, Budi Oetomo, Paguyuban Pasundan, Obligasi Sumatra, Kaum Betawi, dan Klub Studi Indonesische.
Pada 1 Maret 1942, Jepang mendarat di Merak, Teluk Banten , dan di Indramayu. 5 Maret 1942, Jepang menyingkirkan Belanda dari Indonesia dan berhasil menguasai Batavia. Nama Batavia diubah oleh Jepang menjadi Jakarta . Kemudian dimulailah masa penjajahan Jepang di Jawa Indonesia .
pada awal 1945 di Blitar, Jawa Timur , pemberontakan PETA (Pembela Tanah Air) mulai melawan Jepang. Pemberontakan ini dipimpin oleh Supriyadi, Moeradi, Halir Mangkudijoyo, dan Soemarto. Namun pemberontakan ini dihancurkan.
Kolonial Jepang berakhir pada 17 Agustus 1945, ketika Sukarno dan Mohammad Hatta memproklamasikan kemerdekaan Republik Indonesia di jalan Pegangsaan Timur no. 56, Jakarta. Pasca proklamasi, Indonesia berupaya mengambil alih kantor dan peralatan komunikasi yang masih dikendalikan oleh tentara Jepang.
Oktober 1945, Sekutu dan tentara NICA (Administrasi Sipil Hindia Belanda) mendarat di Jakarta. Belanda tampaknya ingin menjajah Indonesia lagi. Kedatangan Sekutu dan NICA disambut dengan pertempuran yang dilakukan berbagai pasukan di seluruh Jakarta.
Pada 19 Oktober 1945, pasukan Sekutu dan dan NICA mendarat di Jawa Tengah. Perlawanan terorganisir Indonesia, perlawanan semacam itu oleh Tentara Keamanan Rakyat ( TKR) di Magelang, Jawa Tengah pada tanggal 31 Oktober dan 9 November 1945.
21 November 1945, Sekutu menarik diri dari Magelang dan pindah ke Ambarawa, Jawa Tengah. Tentara Indonesia kemudian menyerang Ambarawa, ada acara pertempuran selama empat hari empat malam yang dikenal sebagai " Palagan Ambarawa ". 15 Desember 1945, pasukan Sekutu menarik diri dari Ambarawa.
Pada November 1945, perang juga meletus di seluruh wilayah Jakarta. Walikota Jakarta, Soewiryo ditangkap oleh Belanda. Sejak itu, Belanda menguasai Jakarta.
Pada 10 November 1945, perang antara penduduk asli melawan Sekutu dan NICA meletus di kota Surabaya , Jawa Timur .
Pada 27 November 1945, Bandung dibagi menjadi dua wilayah. Wilayah utara jalur kereta api di pusat kota Bandung ditempati oleh Sekutu dan Belanda. Sementara orang Indonesia mengambil alih wilayah selatan rel kereta api.
Pada tanggal 4 Januari 1946, ibukota Republik Indonesia pindah ke Yogyakarta . Semua pemimpin asli Indonesia termasuk Presiden dan Wakil Presiden juga pindah ke Yogyakarta.
Pada 24 Maret 1946, kota Bandung di Jawa Barat ditinggalkan oleh orang Indonesia. Setelah orang-orang Indonesia meninggalkan kota, Bandung dibakar oleh Majelis Persatuan Perjuangan Priangan , MP3) untuk bangunan-bangunan penting yang tidak ditempati oleh Belanda. Acara ini dikenang sebagai " Bandung Lautan Api ".
Pada November 1946 terjadi transisi kekuasaan dari Sekutu ke Belanda. Pada bulan Maret 1947, diadakan negosiasi Linggajati, di Kabupaten Kuningan, Jawa Barat. Negosiasi ini menghasilkan keputusan bahwa Belanda mengakui kedaulatan Indonesia, yang terdiri dari Jawa, Sumatra dan Madura. Kedua pihak sepakat untuk membentuk Republik Indonesia Serikat (RIS).
Pada 21 Juli 1947, meski masih terikat perjanjian gencatan senjata dan perjanjian Linggadjati, Agresi Militer Belanda dan menggerebek beberapa daerah di Jawa Indonesia . Agresi militer Belanda ini berakhir setelah perjanjian Renville.
Partai Komunis Indonesia (Partai Komunis Indonesia, PKI) terjadi pemberontakan pada 18 September 1948 di Madiun. Namun pemberontakan ini bisa dihancurkan oleh Tentara Indonesia.
Pada 19 Desember 1948, militer Belanda menyerang Yogyakarta. Dalam agresi militer Belanda ini, Belanda menangkap Presiden Sukarno dan Wakil Presiden Mohammad Hatta. Meskipun para pemimpinnya ditangkap, orang-orang masih melakukan perlawanan di bawah kepemimpinan Jenderal Sudirman.
Blitar di Jawa Timur, yang masih digunakan sebagai tempat pemerintah provinsi Jawa Timur juga diserang oleh Belanda.
Agresi militer Belanda kedua berakhir setelah persetujuan Roem-Royen tanggal 7 Mei 1949.
Belanda mulai menarik pasukannya setelah Konferensi Meja Bundar (KMB) yang menghasilkan piagam pengakuan Amerika Serikat Indonesia (RIS).
Ketika Indonesia mengadopsi sistem amerika serikat. Jawa dibagi menjadi beberapa negara, seperti negara bagian Jawa Timur, negara bagian Pasundan (Jawa Barat), negara bagian Madura, dan sebagainya. Yogyakarta menjadi pusat administrasi Negara Kesatuan Republik Indonesia (NKRI)
Tetapi orang tidak menyukai sistem pemerintahan ini. Orang-orang menuntut pembubaran negara dan kembali menjadi satu kesatuan lagi. Akhirnya pada 25 Februari 1950, negara Jawa Timur dibubarkan dan menjadi bagian dari wilayah Negara Kesatuan Republik Indonesia. Keputusan ini diikuti oleh negara bagian Madura. Juga pada 8 Maret 1950, negara Pasundan menuntut untuk bergabung kembali dengan Negara Kesatuan Republik Indonesia.
Pada 15 Agustus 1950, RIS dibubarkan dan dikembalikan ke formulir "Republik Indonesia". Pada 17 Agustus 1950, Republik Indonesia didirikan kembali dan ibukota dipindahkan ke Jakarta lagi.
Organisasi mahasiswa seperti HMI, PMII, dan PMKRI pada 17 November 1965 sepakat untuk membentuk Kesatuan Aksi Mahasiswa Indonesia (KAMI) untuk membentuk visi negara baru dan mengikis PKI.
Komandan Strategi Angkatan Darat pada waktu itu, Mayor Jenderal Suharto, menghancurkan kudeta dan melawan PKI. Suharto juga memanfaatkan situasi ini untuk mengendalikan pemerintah Indonesia.
Pada tahun 1968, Soeharto dilantik sebagai presiden untuk masa jabatan 5 tahun, dan ia dilantik lagi beberapa kali.
Pada pertengahan 1997, Indonesia dilanda krisis keuangan dan ekonomi. Ini memicu ketidakpuasan publik. Para siswa mendorong Soeharto untuk mundur. Akhirnya, Soeharto mengundurkan diri pada 21 Mei 1998, Wakil Presiden, BJ Habibie, untuk sementara waktu naik menjadi presiden.
Setelah itu Presiden Indonesia berubah beberapa kali, yaitu Abdurrahman Wahid pada 1999-2000, diikuti oleh Megawati pada tahun 2000-2004. Megawati adalah putri Sukarno (presiden pertama Indonesia). Pada 2004 hingga sekarang Susilo Bambang Yudhoyono terpilih sebagai presiden baru Indonesia.
